Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfixP70257 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfixP70257 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfixP70257 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfixP70257 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms