Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms