Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrig1P70193 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms