Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms