Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Acta1P68134 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Acta1P68134 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Acta1P68134 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Acta1P68134 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Acta1P68134 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms