Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta2P62737 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms