Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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