Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PlnP61014 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PlnP61014 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms