Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csrnp3P59055 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms