Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gp1bbP56400 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gp1bbP56400 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms