Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtswP56203 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtswP56203 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtswP56203 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CtswP56203 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CtswP56203 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CtswP56203 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtswP56203 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtswP56203 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms