Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sh3bp1P55194 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sh3bp1P55194 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sh3bp1P55194 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sh3bp1P55194 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sh3bp1P55194 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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