Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcd3P55096 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms