Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcanP55066 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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NcanP55066 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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NcanP55066 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcanP55066 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcanP55066 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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