Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cacnb3P54285 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacnb3P54285 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms