Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClgnP52194 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms