Protein–RNA interactions for Protein: P51865

Tdgf1, Teratocarcinoma-derived growth factor, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdgf1P51865 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tdgf1P51865 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tdgf1P51865 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tdgf1P51865 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tdgf1P51865 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tdgf1P51865 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Tdgf1P51865 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Tdgf1P51865 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Tdgf1P51865 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tdgf1P51865 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tdgf1P51865 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tdgf1P51865 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tdgf1P51865 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tdgf1P51865 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms