Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfbP49766 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfbP49766 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VegfbP49766 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms