Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms