Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VhlP40338 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VhlP40338 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VhlP40338 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VhlP40338 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VhlP40338 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VhlP40338 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VhlP40338 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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