Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms