Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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