Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms