Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrbP28704 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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