Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NapbP28663 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms