Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lef1P27782 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms