Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pde6aP27664 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6aP27664 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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