Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U2af2P26369 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms