Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CftrP26361 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CftrP26361 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CftrP26361 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms