Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Fcer1aP20489 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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