Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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PdgfaP20033 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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PdgfaP20033 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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PdgfaP20033 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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