Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PcnaP17918 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms