Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms