Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Tnp1P10856 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Tnp1P10856 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms