Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P10404 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P10404 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P10404 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P10404 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms