Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PdgfrbP05622 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PdgfrbP05622 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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