Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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