Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms