Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TsksO54887 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TsksO54887 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TsksO54887 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TsksO54887 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TsksO54887 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TsksO54887 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TsksO54887 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TsksO54887 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TsksO54887 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TsksO54887 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TsksO54887 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms