Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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DffaO54786 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DffaO54786 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DffaO54786 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DffaO54786 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DffaO54786 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DffaO54786 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DffaO54786 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DffaO54786 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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DffaO54786 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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