Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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FxnO35943 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FxnO35943 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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FxnO35943 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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FxnO35943 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FxnO35943 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FxnO35943 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FxnO35943 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FxnO35943 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FxnO35943 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FxnO35943 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FxnO35943 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FxnO35943 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FxnO35943 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FxnO35943 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FxnO35943 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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