Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Dlx5-201ENSMUST00000052609 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm3371-202ENSMUST00000177827 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms