Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Opn1mwO35599 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Opn1mwO35599 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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