Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ebi3O35228 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ebi3O35228 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ebi3O35228 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ebi3O35228 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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