Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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H2-M9O19442 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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H2-M9O19442 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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H2-M9O19442 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-M9O19442 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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