Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8888J3QPX5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm8888J3QPX5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm8888J3QPX5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm8888J3QPX5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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