Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3685J3QPP2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms