Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC024978J3QPC3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BC024978J3QPC3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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BC024978J3QPC3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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