Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Gm20795J3QP49 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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