Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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E030018B13RikJ3QMS9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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